【干貨分享】細胞信號通路研究全套資料下載

縱觀現如今的科研發展趨勢,無論哪方面的研究都脫離不了分子機制,其實歸根結底就是搞明白信號通路中上下游的基因是怎么調控的,受到了哪些因素的影響,其網絡的復雜程度和研究的難度,想想都讓人卻步,好在我們站在了巨人的肩膀之上,科學家及相關專家已經幫我們整理成了交互性信號轉導通路示意圖,以便于我們獲取最直接的科研思路。

具體的細胞信號通路,可通過關注“百邁客醫學”公眾號,回復“細胞信號通路”下載。

信號通路研究策略

之前,在博客上看到過一篇信號通路研究策略的博文,在此分享一下:

以信號通路為主題的研究,一般來說,按照研究深度可以分為包括:效應、通路、分子和序列四個層面,研究步驟如下:

1、從效應出發(如細胞凋亡),通過涵蓋多通路的手段進行中等通量的篩選(蛋白或者RNA水平,比如蛋白芯片或者PCR芯片等),以確定參與該效應的通路,以及該通路的激活或者抑制狀態;

2、以某一通路為單位,通過低通量實驗WB、qPCR等手段,明確通路中的關鍵分子的變化,比如表達差異、定位異常、活性變化等;

3、以某一分子為單位,通過分子共表達相關性、分子互作手段(如IP、GST-Pull down等)、分子定位、活性、構象等檢測手段,進一步明確分子作用的方式,以及結合的序列、結構域等。

第一步驟的研究是以效應為單位的分解,分解產出是通路。這里說的效應是比較大的概念,比如既可以是疾病水平,又可以是細胞水平,比如在確定腫瘤轉移相關通路時,既可以通過轉移、非轉移樣本進行篩選,又可以通過不同轉移能力的細胞系進行篩選,這時基本單元是通路,而通路的狀態又可以分為激活、抑制等。那么如何判斷一條通路是被激活還是被抑制?答案是看通路的下游效應分子應答表現,比如被上調、被激活還是重定位等等。

第二步驟的研究是以通路為單位的分解,分解產出是分子。通路與分子類似,既可以看通路被激活、抑制的上游即原因,也可以看通路被激活、抑制的下游即結果, 不過很少說通路被上下調。即:我們看到的是一個黑箱(Black Box),我們知道效應改變下某一通路被激活或抑制,而通路涉及太多分子,信號在通路中逐級放大。我們可能檢測到了一些分子在通路中異常,卻不知道哪些分子是信號接收放大的起點。因此第二步驟的目的是從諸多分子中找到通路中信號接收的起點。從通路到信號接收分子的實驗方法一般有:共表達關系、直接互作、共定位等。

第三步驟的研究是以分子為單位的分解,分解產出是序列。這一步驟承接第二步,在找到關鍵分子后,對分子進行分解到結構域和位點,一般做到這個程度的話就已經非常偏基礎了,這也是高分文章通路研究中的不成文規定。

信號通路畫圖軟件

不是所有的研究都有現成的細胞信號通路圖,假如沒有,你需要用到下面的2款軟件進行自己繪圖:

1、ScienceSlides2005
ScienceSlides 2005是一個PowerPoint插件,包含1600多個生物醫學相關對象,在做PPT文件時可以直接通過工具條插入使用這些對象,從而免去了到處找相關文件的麻煩,也省了要切換軟件拷貝粘貼的麻煩,提高做PPT的效率。ScienceSlides 2005的對象和模板涉及Biochemistry、Pharmacology、Methods、Biology、CommonShapes、Molecular、Pathology、Signaling等領域。

 

2、Portable Pathway Builder Tool V2.0
pathway builder tool簡單易學,美觀,自帶幾乎所有分子生物學會用到的元素,如不同的細胞,細胞器,分子,老鼠模型… 另外,這個軟件自帶很多經典通路,在上面可以直接修改,非常方便,修改完成后可以保存。

 

軟件下載方式

ScienceSlides2005:關注“百邁客醫學”公眾號,回復“ScienceSlides”下載
Portable Pathway Builder Tool V2.0:關注“百邁客醫學”公眾號,回復“Pathway Builder”下載
信號通路研究策略引自小張聊科研的博客:http://blog.sina.com.cn/u/5908556998
細胞信號通路收集自Cell Signaling Technology:https://www.cst-c.com.cn/contents/science/cst-pathways/science-pathways

 

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