heat map圖怎么做?不會編程也能自己繪制heatmap!

做轉錄組測序的客戶經常需要把自己關注的功能或通路相關的基因繪制heatmap熱圖,或者不滿意公司提供的紅紅綠綠的heatmap圖。如果您想通過R語言包等繪制heatmap圖,可以看一下我們前面分享的畫圖專題|熱圖函數pheatamp()。

heat map圖怎么做?對于一看代碼就頭疼的,只好另辟蹊徑。今天,給大家介紹一個不需要編程基礎,甚至不需要下載軟件的在線熱圖繪制工具。

1、小編首推的還是百邁客的云平臺小工具,簡單易用。

小工具網址:

https://international.biocloud.net/zh/software/tools/detail/small/305

輸入文件示例:

可選的配色方案也比較多,基本能滿足我們的需求:

軟件輸出結果示例:

2、百邁客云平臺繪圖工具包中的熱圖工具

https://console.biocloud.net/static/index.html#/drawtools/intoDrawTools/heatmap/input

輸入文件與設置同上一個工具類似,只是其配色支持自定義,且支持預覽:

預覽效果圖滿意后,即可下載繪圖結果:

3、heat map圖怎么做?推薦第三個方法:安裝軟件HemI。

該軟件下載地址:http://hemi.biocuckoo.org/down.php,即可下載安裝包(HemI_windows_1_0_win32_x64)和使用說明書。

A: 列標題。B: 行標題。C: 行聚類效果。D: 列聚類效果。E: 顏色標尺。F: 畫布大小(像素)。G: A (頂部)/D (底部) 的高度和B (左側)/C (右側)的寬度。(像素)

H: 對橫縱坐標標題(行標題,列標題)的設置,包括位置、字體。

I: 是否對行/列進行聚類。

J: 旋轉設置, X-axis:列標題文字的旋轉角度(A), Y-axis: 行標題文字的旋轉角度(B),

Graph: 畫布的旋轉角度(例如,旋轉90°,將橫縱坐標切換)。

K: 設置heatmap的色系。

L: 各項命令。無論您更改了什么設置,需要點擊“REFRESH”按鈕才會生效。

也就是您可以每更新完一項參數,都可以REFRESH后看效果,效果滿意后即可下載。

點擊L框中的LOAD按鈕即可打開要生成heatmap的文件,excel格式也可以。X-axis title是選擇橫軸坐標對應到輸入文件的哪一行,選擇auto select自動選擇矩陣數據。

點擊K框中的set按鈕,可以自定義顏色(舊版是customized)。

定義顏色標尺連續或不連續,右鍵Set up bar;Set up statistic: 設置繪制此熱圖使用到的數學上的屬性(歸一化和聚類方法),一般二代數據選擇對數歸一化方式。

 

該軟件還可以設置熱圖到邊距的距離,相當于調整行列的寬度,大家可以自行摸索下,簡單易用。

 

最近文章
网络棋牌看牌器 真人版炸金花赢现金app 一分时时彩开奖网站 皇冠24500即时比分 六肖中特期期准王中王 福建时时奖金规则 福利彩票2019054期开奖结果 下载捕鱼游戏 我有无限技能点 网上跟计划买彩票稳吗 搜重庆时时杀号预测 湖北快三专家预测号码 网赌ag真人是骗局吗 极速时时中心 云南快乐十分秘诀 玩时时彩是不是就没有盈利的 最好玩的手机游戏