生信零基礎,如何進行代謝組學生信分析?

還記得3月6日驚蟄,百邁客發生的大事件嗎?沒錯,為了幫助廣大科研工作者獲得更準確的檢測數據,百邁客強勢引進Waters UPLC I class PLUS 及Xevo G2-XS QTOF,同時全面上線代謝組云分析工具,極速縮短分析周期,提升個性化數據挖掘空間。

那么今天來嘮一嘮全面上線的代謝組云分析平臺,該平臺優勢在于生信零基礎的科研小伙伴,也能快速進行代謝組學數據分析哦,閑話不說,來來來,聽大神絮叨一會,小白也能秒變大神呢,come,on!

代謝組云分析平臺是什么?

百邁客云提供專業的生信分析平臺(http://www.biocloud.net/),最新上線的代謝組云APP兼具標準分析、聯合分析和個性化分析功能,同時海量在線資源以供學習和使用。

代謝組APP如何使用?

首先,您需要登錄到百邁客云平臺網址(http://www.biocloud.net/),點擊全部導航->分析->農學

在農學分析各平臺右側選擇代謝組分析平臺,如下圖:

點擊,選擇打開軟件

打開軟件之后,代謝組信息分析開始了,首先輸入項目名稱,用于區分不同的分析項目。

正式分析開始了哦,總共分3步:

第一步

在代謝定量文件中導入質譜檢測得到的代謝物的定量文件

?

文件的格式如下:

注:第一列為代謝物ID,第二列為代謝物定性名稱,第三列至最后為各個樣本的定量信息。

第二步

綜合選項選擇,包括注釋物種分類、分析報告名稱、物種名、歸一化方式等

 

KEGG注釋分類:根據我們所分析的物種選擇相對應的分類。這樣方便我們得到更準確的注釋結果。

歸一化方式:對我們的定量結果進行標準化的方式。如果我們自己已經做過歸一化,那么選擇否就可以。

第三步
設置差異分析的條件:包括差異倍數、T檢驗p值、VIP值、以及差異分組

在進行分組設置時,我們可以自由添加分組,設置自己的組名,并在組名之后添加用于差異分析的樣品。

最后點擊提交,半個小時即可輕松完成12項標準分析內容啦!剩下的就是坐等分析結果嘍~

當然除了以上標準分析,云平臺可以進行深入的個性化分析以及多組學聯合分析(代謝組和轉錄組聯合、代謝組和微生物聯合),有木有很期待,掃描以下二維碼報名,下期大神教小白如何進行個性化和聯合分析哦。

 

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