物種數據庫幫您更快發表高分文章!

百邁客物種數據庫是一個將多組學數據高度整合、集成在一起,實現數據的瀏覽、查詢、再度挖掘的綜合性平臺。

為了更好的服務于科研,物種數據庫推出了V2.0版:不但可共享研究成果,而且通過后臺管理系統可以完成logo、文字描述、配色、單位等信息的修改,更重要的是可以實現新增數據的一鍵式部署。

更更重要的是,數據庫也可以發表高分文章哦!

百邁客物種數據庫核心功能介紹

標準版數據庫:http://bio-db-demo.biocloud.net/home

  • Browse

標準版Browse模塊中共部署了7個子模塊進行核心數據的瀏覽,如Browse中的Annotation模塊,鏈接:http://tomato.biocloud.net/page/browse/Annotation

功能說明:

  • 選擇物種
  • 選擇所關心的注釋數據庫類型(默認是All)
  • 輸入所關心的基因ID或者功能注釋關鍵字

  • Search

標準版Search模塊中共部署了5個子模塊完成數據的查詢、檢索,如Search模塊中的Multicriteria Search,

鏈接:http://bio-db-demo.biocloud.net/page/search/multicriteriaSearch

功能說明:

  • 選擇待檢索的變異類型,SNP ?或者 Indel
  • 選擇在哪個版本的參考基因組中檢索結果
  • 輸入檢索的染色體區域
  • 輸入要檢索的基因ID
  • 輸入要檢索的變異ID

注 3、4、5三個選項只能選擇一個哦!

  • 選擇要在哪個品種中進行檢索
  • 具體要檢索的Type類型
  • 具體要檢索的基因型Genotype

點擊Search后,即可完成特定樣品在特定條件下的變異詳情信息了,結果中還包括了變異位點上下游20bp、及500bp的序列信息,便于用戶進行引物設計。

  • Tools

標準版Tools模塊中共部署了8款工具用于對庫中多組學數據的進一步深度挖掘:

如Tools模塊中的Expression Visualization,

鏈接:http://bio-db-demo.biocloud.net/page/tools/expressionVisualization

功能說明:

  • 輸入關心的基因ID,基因ID之前以逗號分隔
  • 選擇特定個體、特定組織在特定處理條件下的樣品

點擊“Display Expression Heatmap”即可構建出表達量熱圖

  • 后臺管理

通過管理員賬號登錄后臺后,不但可以編輯背景色、輪播圖、各個模塊的文字描述,而且底層數據也可以通過后臺進行上傳、管理。

再也不需要占用一個被灰塵落滿的硬盤存儲科研數據了;

再也不需要配備專業的美工去完成頁面背景色的修改了;

再也不需要哀求專業的IT開發工程師、運維工程師去完成底層數據的更新了(替換、追加隨您便);

背景色的編輯:

Home頁內容編輯:

我們通過上面4部分內容,對百邁客物種數據庫的功能做了一個簡單的介紹。

如果想了解更多的功能,

如果想了解更多的后臺管理功能

如果您想為您的科研數據部署一個數據庫

請通過網站查看–http://bio-db-demo.biocloud.net/home

 

成功案例:

蝦數據庫:http://shrimp.biocloud.net

番茄數據庫:http://tomato.biocloud.net

橡膠樹數據庫

包括4份草圖基因組、遺傳變異數據、轉錄數據、表型數據等多組學數據信息,為科學家進一步研究提供幫助。

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柑橘數據庫

包含246個樣本的Snp/Indel變異結果及性狀數據,并且部署了CitEVOL等分析工具,用于進行PCA、進化樹構建等分析。

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