百邁客再次引進最新三代測序平臺PacBio Sequel Ⅱ

為更好的服務于用戶,百邁客與基因公司達成合作,再次引進PacBio公司最新的Sequel Ⅱ平臺,該平臺已于5月23日到達北京百邁客生物科技有限公司青島分公司,目前已經完成內部測試,正式投產!當前,百邁客已擁有PacBio RS Ⅱ、PacBio Sequel、PacBio sequel Ⅱ、Nanopore PromethION、Nanopore GridION、Nanopore MinION市場上主流的三代測序平臺,為客戶提供最全面優質的選擇!

【PacBio SMRT測序原理】

PacBio 提供的是一種邊合成邊測序的單分子實時測序技術。測序時,DNA聚合酶與模板鏈結合,在鏈合成的過程中,不同熒光標記的堿基會釋放不同的熒光信號,根據光的波長與峰值從而判斷堿基類型與順序。

PacBio SMRT測序原理

目前市面上的Pacbio平臺有:PacBio RSⅡ、PacBio Sequel、PacBio Sequel Ⅱ三種,其原理相同。隨著新平臺發布,測序的通量會提升,單G成本會降低。

【Sequel Ⅱ介紹】

?Sequel II 相較于前代產品,在通量提升成本降低的同時,也提供了新的測序模式

1、新的測序模式:CLR與CCS文庫

當前Sequel II平臺可提供CLR Library和CCS library(HIFI)兩種測序模式。

CLR Library與之前廣為理解的測序文庫相同,采用15 Kb、20 Kb、30 Kb等長片段類型的DNA片段進行文庫構建,通過獲得Subreads來進行下一及應用拓展。

CLR Library 測序原理

最新提供的CCS文庫,即采用如8Kb,10Kb等小片段文庫,進行單一片段多輪測序的方式來提升準確性。由于Pacbio的原始錯誤為隨機錯誤,可通過CCS模式進行自身糾正,來提升數據的準確性,先前ISO-seq就是CCS文庫的典型應用。CCS reads無需二代數據再次糾錯,具有較高準確性,為基因組組裝,高精度基因組注釋、變異檢測等應用提供了更有利的支持。據官方數據,同一片段測序4次后,單一read的準確性可達99%。

CCS Library(HiFi)測序原理

2、數據量產出提高

Sequel II 相比于前代測序平臺Sequel,主要變化是測序芯片上的導孔(ZMW)由原始的100萬個提升至800萬個,理論通量直接提升8倍,進而提升了單Cell數據產量,成本也隨之越低!

Sequel II與Sequel平臺比對

 

【百邁客新舊平臺同一樣品實測數據展示】

百邁客利用某海洋動物樣本通過構建相同文庫,進行不同平臺的數據測試。通過構建20 Kb的文庫,同時在Sequel與SequelⅡ上進行上機測序,數據產出結果如下所示:

Subreads 數據比對統計

注:Subreads是產出的所有subreads數據集;Reads Num:reads數目;Total Bases (bp):堿基總數;Reads N50 (bp):將reads從長到短排序,并依次相加,當加和等于總堿基數目一半時對應的那條reads長度即為reads N50;Mean Length (bp):reads的平均長度;Longest Read (bp):最長read的長度。

結果統計表中我們可以看到,Sequel Ⅱ平臺ZMWs數量較Sequel平臺的提升至其8倍,而單cell的總數據量產出由原始的11.6 Gb/cell提升至103.3 Gb/cell,整整高出了約8倍!而在平均讀長,最長讀長,Reads N50 方面未有太大變化。2個平臺的讀長分布情況如下圖所示:

PacBio sequel讀長分布

PacBio Sequel Ⅱ讀長分布

 

【百邁客三代測序平臺展示】

小結

百邁客自2015年引入Pacbio測序平臺后,在三代測序領域已擁有大量項目經驗及成功案例。依托于豐富的項目經驗,此次平臺引入將更好的服務于用戶,為用戶提供更加全面,更加快速,更具性價比的服務與選擇。更多詳情請咨詢400-600-3186及當地銷售!

Biomarker——打造生物行業標志性產業!

 

【百邁客合作項目成果展示】

 

點擊下方按鈕體驗Sequel Ⅱ測序平臺

 

 

最近文章
网络棋牌看牌器 广东快乐十分开奖号码查询 幸运彩走势图 固定公式规律抓特法i 北京时时奖记录 愤怒乒乓球 河南幸运彩走势图app 腾讯五分彩如何看走势 天津时时技巧 安徽快3时时彩 重庆时时网址合买 香港赛马会六会彩走势图 世青赛比赛结果 甘肃11选5开奖直播 快乐时时计划软件手机版 四ill快乐12最大遗漏 山东福彩群英会玩法